Переход к рыночным отношениям ослабил существовавшую ранее систему централизованного государственного финансового контроля. Опыт стран с развитой рыночной экономикой показывает, что интересы государства и общества в целом при децентрализованной экономике могут быть эффективно защищены только при условии соответствующего государственного контроля, особенно в налоговой и бюджетно-финансовой сфере.

      Поскольку организация и функционирование эффективной системы финансового  контроля – обязательный и непременный  элемент финансовой политики, то в общей системе мер перестройки финансового механизма совершенствование системы финансового контроля стало важным элементом государственной политики.

        Таким образом, новые политические  и экономические отношения, сложившиеся  в России за последние годы, потребовали создания развитой системы государственного финансового контроля, способной в условиях децентрализованного управления экономикой обеспечить соблюдение интересов государства и общества в целом. Построение такой системы должно было учесть опыт, накопленный в России до 1917г. и в СССР, и опыт стран с развитой рыночной экономикой.

      Децентрализация экономики, отчуждение государственной  собственности в частное владение уменьшили прежние источники государственных доходов, что заставило искать источники пополнения государственной казны, более приемлемые для рыночных условий.

      В первую очередь усилия государства  были направлены на существенную модификацию налоговой системы страны. В частности, были приняты меры, направленные на развитие и укрепление налоговой полиции.

      Для обеспечения надлежащего контроля со стороны Правительства РФ за формированием  государственных доходов и рациональным их использованием были сохранены и даже расширены функции контрольно-ревизионных органов Минфина России. Органы исполнительной власти субъектов Федерации также стали создавать контрольно-ревизионные органы для контроля за находящимися в их распоряжении финансовыми ресурсами.

      Федеральным законом № 4-ФЗ от 18 января 1995 года «О счетной палате Российской Федерации» был образован орган внешнего государственного контроля в России – Счетная палата Российской Федерации. Одновременно аналогичные органы стали создаваться на уровне субъектов Федерации. Этим было положено начало созданию в России института внешнего государственного финансового контроля.

      При создании органов внешнего государственного финансового контроля был учтен опыт организации такого контроля в демократических странах с развитой рыночной экономикой, согласно которому ключевая роль в проведении государственного финансового контроля отводится законодательным (представительным) органам власти и создаваемым ими органам высшего государственного финансового контроля.

      Таким образом, построение системы органов  внешнего государственного финансового контроля в современной России проводилось приблизительно по одной схеме как на федеральном, так и на уровне субъектов Федерации. При этом в основном соблюдались следующие основные принципы осуществления государственного финансового контроля:

      - законность;

      - объективность;

      - разграничение органов государственного финансового контроля в соответствии с установленным законодательством Российской Федерации разграничением функций и полномочий органов законодательной и исполнительной власти;

      - подотчетность органам государственной  власти Российской Федерации;

      - функциональная, организационная и  финансовая независимость;

      - гласность.

      В отличие от других контролирующих систем контрольные органы Минфина сумели сохраниться в ходе преобразований, совершаемых в стране, и сегодня по-прежнему представляют собой наиболее мощный коллектив наиболее опытных и, что не мало важно, самоотверженных преданных своему делу работников. Контрольно-ревизионный аппарат Минфина России в целях восстановления финансовой контрольной вертикали реорганизован. В центральном аппарате министерства создан Департамент государственного финансового контроля, унаследовавший задачи и функции упраздненного Контрольно-ревизионного управления.

      На  местах на базе аппаратов главных  контролеров-ревизоров КРУ Минфина  России в 1998 году были образованы контрольно-ревизионные управления Минфина России в субъектах Российской Федерации на правах юридических лиц. Они действовали автономно от местных органов власти, в необходимых случаях – по договорам с этими органами, что вполне соответствует нормам федеративного государства.

      В ходе реформы органов государственной  власти в 2004 году была образована Федеральная служба финансово-бюджетного надзора, которой были переданы задачи и функции государственного финансового и валютного контроля.

     Распоряжением Правительства  РФ от 30 июля 2004 г. N 1024-р Федеральной службе финансово-бюджетного надзора переданы в ведение контрольно-ревизионные органы и территориальные органы по валютному контролю Минфина РФ на базе которых созданы территориальные органы федеральной службы финансово-бюджетного надзора.